En resumen
- Para empezar gratis: la aplicación gratuita de la Agencia Tributaria o el plan básico de Contasimple.
- Para la mayoría de autónomos: Holded o Quipu, por equilibrio entre precio, facturación e impuestos.
- Para trabajos en la calle o con stock: STEL Order.
- Para vender a clientes de otros países: Quaderno.
- Elijas el que elijas, comprueba que está adaptado a Verifactu, obligatorio para autónomos desde el 1 de julio de 2027.
Un buen programa de facturación hace mucho más que emitir facturas bonitas: numera correctamente, calcula el IVA y la retención, registra tus gastos, te prepara los modelos trimestrales y, desde 2027, garantiza que cumples con Verifactu. Hemos comparado las opciones más usadas por autónomos en España según precio, funciones y tipo de negocio.
Comparativa rápida
| Programa | Precio orientativo | Plan gratis | Mejor para |
|---|---|---|---|
| Aplicación de la AEAT | Gratis | Sí | Quien emite pocas facturas y quiere lo mínimo |
| Contasimple | Gratis o desde 12,95 €/mes | Sí | Autónomos que empiezan |
| Holded | Desde 15 €/mes | No (prueba de 14 días) | Autónomos digitales que quieren todo en uno |
| Quipu | Desde 17 €/mes | No (prueba de 15 días) | Automatizar impuestos y gastos |
| STEL Order | Gratis o desde 18 €/mes | Sí | Oficios, servicio técnico, stock |
| Quaderno | Desde 24 $/mes | Prueba | Ventas online e internacionales |
Precios sin IVA consultados en octubre de 2026. Cambian con frecuencia: comprueba siempre la web oficial.
Qué debe tener un programa de facturación para autónomos
- Adaptación a Verifactu garantizada por el fabricante. Es lo primero que debes preguntar. Te lo explicamos en factura electrónica obligatoria y Verifactu.
- Numeración correlativa y series, facturas rectificativas y presupuestos.
- Retención de IRPF configurable si eres profesional.
- Registro de gastos con lectura automática de tickets.
- Conexión bancaria para conciliar cobros y pagos sin teclear.
- Borradores de los modelos 303 y 130, o acceso sencillo para tu gestoría.
Análisis de cada opción
Aplicación gratuita de la Agencia Tributaria
Hacienda ofrece una aplicación gratuita para emitir facturas cumpliendo Verifactu, pensada para autónomos con muy pocas facturas. Es suficiente para facturar, pero no lleva gastos, contabilidad ni conexión bancaria. Si facturas a unos pocos clientes al mes y tienes gestoría, puede bastarte.
Contasimple
Tiene un plan básico gratuito con el que puedes facturar y registrar gastos, y planes de pago con más volumen, contabilidad e impuestos. Es una buena puerta de entrada para quien se acaba de dar de alta y quiere gastar lo mínimo el primer año.
Holded
Es el programa más completo de la lista: facturación, gastos, contabilidad, impuestos, proyectos y un pequeño CRM en la misma herramienta. Todos sus planes incluyen facturación con Verifactu. El plan más económico, Plus, cuesta 15 € al mes sin IVA e incluye hasta 250 facturas al año para un usuario, suficiente para la mayoría de autónomos. Su punto débil es que muchas funciones pueden resultar excesivas si solo quieres facturar.
Quipu
Está muy centrado en la parte fiscal: registra gastos a partir de fotos, concilia con el banco y prepara los impuestos trimestrales. Encaja bien con autónomos que quieren reducir al mínimo el tiempo dedicado a los modelos o que trabajan codo con codo con su asesor.
STEL Order
Pensado para quien trabaja fuera de la oficina: fontaneros, electricistas, instaladores o servicio técnico. Permite hacer presupuestos, albaranes y facturas desde el móvil, controlar stock y recoger la firma del cliente. Tiene plan gratuito y planes de pago con más funciones.
Quaderno
Su especialidad es calcular automáticamente los impuestos de cada país cuando vendes online o a clientes extranjeros, y conectarse con tiendas y pasarelas de pago. Si vendes cursos, software o productos digitales a toda Europa, te ahorra muchos quebraderos de cabeza.
¿Y la facturación que incluye mi banco?
Algunos neobancos, como Qonto, integran un módulo de facturación en la cuenta. Es cómodo porque las facturas y los cobros quedan conectados, pero suele ser más básico en gastos e impuestos. Puede ser suficiente si te apoyas en una gestoría. Si quieres elegir banco y programa a la vez, prueba nuestra calculadora de combinación.
Nuestra recomendación según tu caso
- Acabas de empezar y facturas poco: Contasimple gratis o la aplicación de la AEAT.
- Freelance o profesional con clientes en España: Holded Plus o Quipu.
- Oficios y trabajos a domicilio: STEL Order.
- Ventas online o clientes en el extranjero: Quaderno.
Sea cual sea tu elección, aprovecha el periodo de prueba para emitir un par de facturas reales y comprobar que el programa encaja con tu forma de trabajar antes de pagar.
Comparativa de funciones
| Función | App AEAT | Contasimple | Holded | Quipu | STEL Order | Quaderno |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Facturas con Verifactu | Sí | Sí | Sí | Sí | Sí | Comprobar |
| Registro de gastos | No | Sí | Sí | Sí | Sí | Limitado |
| Lectura de tickets con foto | No | Sí | Sí | Sí | Según plan | No |
| Conexión bancaria | No | Según plan | Sí | Sí | Según plan | No |
| Borradores de 303 y 130 | No | Según plan | Sí | Sí | Según plan | No |
| Impuestos de otros países | No | No | Básico | Básico | No | Sí |
| Presupuestos y albaranes | No | Sí | Sí | Sí | Sí | No |
| App móvil | No | Sí | Sí | Sí | Sí | Sí |
Funciones según la información pública de cada programa en septiembre de 2026. «Según plan» indica que no está en el plan más barato o gratuito.
Cuánto cuesta al año
| Programa | Coste anual orientativo sin IVA |
|---|---|
| Aplicación de la AEAT | 0 € |
| Contasimple (plan gratis) | 0 €, hasta 12 documentos al año |
| Contasimple (plan de pago) | Desde unos 131 € (pago anual) |
| Holded Plus | 180 € |
| Quipu | Desde unos 204 € |
| STEL Order | 0 € en el plan gratis; desde unos 216 € en los de pago |
Todas las cuotas son gasto deducible y el IVA de la factura del programa se recupera en el modelo 303. En la práctica, un programa de 15 € al mes le cuesta a un autónomo bastante menos después de impuestos.
Cómo elegir en cinco preguntas
- ¿Cuántas facturas emites al mes? Menos de cinco: una opción gratuita. Más de cinco: un programa de pago te ahorra tiempo.
- ¿Quién presenta tus impuestos? Si lo haces tú, necesitas borradores de 303 y 130. Si tienes gestoría, basta con facturar bien y que tu gestoría pueda acceder.
- ¿Trabajas en la calle? Necesitas app móvil con presupuestos y firma del cliente.
- ¿Vendes fuera de España? Necesitas que el programa calcule el IVA de cada país.
- ¿Qué banco usas? Comprueba que el programa se conecta con él. Lo explicamos en conectar tu banco con tu software.
Cómo pasar de Excel a un programa de facturación
- Elige el momento: lo ideal es empezar un trimestre o un año nuevo, para no mezclar sistemas en el mismo periodo.
- Crea una serie nueva de numeración o continúa la correlativa desde tu última factura, sin saltos.
- Importa tus clientes y productos desde una hoja de cálculo; casi todos los programas lo permiten.
- Configura IVA y retención por defecto y tus datos fiscales.
- Conecta el banco y la cuenta de correo desde la que enviarás las facturas.
- Guarda tus facturas antiguas en PDF al menos cuatro años.
Hazlo con margen antes del 1 de julio de 2027, cuando Verifactu sea obligatorio para los autónomos.
Entre las opciones de código abierto destaca FacturaScripts, gratuito y muy personalizable si no te importa configurarlo. Y si tu duda es el coche, tienes las claves fiscales en renting de coche para autónomos.
Preguntas frecuentes
¿Cuál es el programa de facturación gratis más completo?
Para facturar cumpliendo Verifactu, la aplicación de la Agencia Tributaria. Si además quieres registrar gastos, el plan gratuito de Contasimple. Te contamos sus límites en programas de facturación gratis.
¿Mi gestoría puede trabajar en mi programa?
En Holded, Quipu y la mayoría de programas de pago puedes dar acceso a tu gestoría, que trabajará directamente con tus datos. Pregúntale antes qué programa prefiere.
¿Qué pasa con mis facturas si dejo de pagar el programa?
Descárgalas antes de cancelar: debes conservarlas al menos cuatro años. La mayoría de programas permiten exportarlas en PDF y los libros en hoja de cálculo.
¿Holded o Quipu?
Holded si quieres gestionar todo el negocio (proyectos, stock, CRM) en un sitio; Quipu si tu prioridad son los impuestos y los gastos. Lee Holded opiniones.
¿El programa de facturación desgrava?
Sí. Es un gasto necesario para tu actividad: se deduce en el IRPF y su IVA se recupera en el modelo 303.
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